Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PDP1Q9P0J1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms