Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR88Q6ZMY6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms