Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC62Q6P9F0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms