Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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