Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH18Q13634 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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