Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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