Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms