Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP1P59025 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP1P59025 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP1P59025 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP1P59025 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP1P59025 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP1P59025 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP1P59025 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP1P59025 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP1P59025 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTP1P59025 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTP1P59025 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTP1P59025 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTP1P59025 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTP1P59025 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTP1P59025 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTP1P59025 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP1P59025 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP1P59025 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP1P59025 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP1P59025 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP1P59025 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP1P59025 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP1P59025 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP1P59025 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP1P59025 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP1P59025 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP1P59025 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP1P59025 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP1P59025 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP1P59025 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP1P59025 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP1P59025 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP1P59025 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP1P59025 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP1P59025 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP1P59025 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP1P59025 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP1P59025 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP1P59025 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP1P59025 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP1P59025 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP1P59025 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP1P59025 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTP1P59025 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTP1P59025 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTP1P59025 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTP1P59025 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RTP1P59025 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP1P59025 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP1P59025 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP1P59025 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP1P59025 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP1P59025 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP1P59025 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP1P59025 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP1P59025 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP1P59025 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP1P59025 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP1P59025 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP1P59025 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP1P59025 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP1P59025 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP1P59025 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP1P59025 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP1P59025 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP1P59025 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP1P59025 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP1P59025 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP1P59025 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP1P59025 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP1P59025 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP1P59025 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP1P59025 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP1P59025 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms