Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM3P06753 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM3P06753 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM3P06753 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM3P06753 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM3P06753 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM3P06753 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM3P06753 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM3P06753 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM3P06753 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM3P06753 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM3P06753 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM3P06753 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM3P06753 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM3P06753 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM3P06753 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM3P06753 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM3P06753 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM3P06753 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM3P06753 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM3P06753 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM3P06753 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM3P06753 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM3P06753 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM3P06753 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM3P06753 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM3P06753 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM3P06753 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM3P06753 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM3P06753 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM3P06753 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM3P06753 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM3P06753 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM3P06753 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM3P06753 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM3P06753 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM3P06753 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM3P06753 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM3P06753 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM3P06753 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM3P06753 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM3P06753 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM3P06753 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM3P06753 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM3P06753 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM3P06753 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM3P06753 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM3P06753 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM3P06753 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM3P06753 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM3P06753 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM3P06753 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TPM3P06753 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TPM3P06753 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TPM3P06753 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM3P06753 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM3P06753 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM3P06753 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM3P06753 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM3P06753 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM3P06753 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM3P06753 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM3P06753 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM3P06753 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM3P06753 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM3P06753 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM3P06753 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM3P06753 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM3P06753 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM3P06753 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM3P06753 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM3P06753 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM3P06753 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM3P06753 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM3P06753 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM3P06753 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms