Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB6O95452 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB6O95452 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB6O95452 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB6O95452 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB6O95452 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB6O95452 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB6O95452 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB6O95452 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB6O95452 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB6O95452 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB6O95452 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB6O95452 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB6O95452 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB6O95452 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB6O95452 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB6O95452 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB6O95452 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB6O95452 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB6O95452 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB6O95452 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB6O95452 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB6O95452 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB6O95452 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB6O95452 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB6O95452 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB6O95452 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB6O95452 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB6O95452 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB6O95452 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB6O95452 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB6O95452 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB6O95452 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB6O95452 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB6O95452 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB6O95452 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB6O95452 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB6O95452 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB6O95452 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB6O95452 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB6O95452 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB6O95452 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB6O95452 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB6O95452 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB6O95452 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB6O95452 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB6O95452 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB6O95452 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB6O95452 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB6O95452 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB6O95452 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB6O95452 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB6O95452 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB6O95452 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB6O95452 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB6O95452 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB6O95452 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB6O95452 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB6O95452 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms