Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSO75390 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSO75390 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSO75390 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSO75390 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSO75390 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSO75390 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSO75390 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSO75390 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSO75390 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSO75390 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSO75390 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSO75390 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSO75390 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSO75390 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSO75390 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSO75390 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSO75390 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSO75390 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSO75390 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSO75390 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSO75390 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSO75390 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSO75390 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSO75390 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSO75390 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSO75390 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSO75390 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSO75390 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSO75390 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSO75390 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSO75390 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSO75390 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSO75390 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSO75390 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSO75390 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSO75390 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSO75390 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSO75390 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSO75390 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSO75390 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSO75390 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSO75390 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSO75390 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSO75390 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms