Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms