Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
U3KQE9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
U3KQE9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
U3KQE9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
U3KQE9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
U3KQE9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
U3KQE9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
U3KQE9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
U3KQE9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
U3KQE9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
U3KQE9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
U3KQE9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
U3KQE9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
U3KQE9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
U3KQE9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
U3KQE9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
U3KQE9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
U3KQE9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
U3KQE9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms