Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.3 ms