Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
TNIKQ9UKE5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
TNIKQ9UKE5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms