Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms