Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms