Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW1

AP2M1, AP-2 complex subunit mu, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2M1Q96CW1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP2M1Q96CW1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms