Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNE4Q8N205 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms