Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC30Q5VVM6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC30Q5VVM6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms