Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FXNQ16595 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FXNQ16595 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FXNQ16595 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FXNQ16595 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FXNQ16595 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FXNQ16595 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FXNQ16595 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FXNQ16595 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FXNQ16595 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FXNQ16595 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FXNQ16595 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FXNQ16595 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FXNQ16595 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FXNQ16595 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FXNQ16595 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FXNQ16595 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FXNQ16595 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FXNQ16595 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FXNQ16595 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FXNQ16595 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FXNQ16595 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FXNQ16595 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FXNQ16595 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FXNQ16595 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FXNQ16595 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FXNQ16595 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FXNQ16595 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FXNQ16595 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FXNQ16595 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FXNQ16595 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FXNQ16595 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FXNQ16595 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FXNQ16595 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FXNQ16595 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FXNQ16595 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FXNQ16595 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FXNQ16595 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FXNQ16595 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FXNQ16595 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FXNQ16595 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FXNQ16595 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FXNQ16595 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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FXNQ16595 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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FXNQ16595 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FXNQ16595 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FXNQ16595 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FXNQ16595 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FXNQ16595 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FXNQ16595 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FXNQ16595 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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FXNQ16595 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FXNQ16595 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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FXNQ16595 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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FXNQ16595 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FXNQ16595 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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FXNQ16595 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FXNQ16595 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FXNQ16595 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FXNQ16595 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FXNQ16595 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FXNQ16595 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FXNQ16595 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FXNQ16595 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FXNQ16595 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FXNQ16595 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FXNQ16595 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FXNQ16595 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FXNQ16595 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FXNQ16595 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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