Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTF3Q12996 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CSTF3Q12996 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSTF3Q12996 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTF3Q12996 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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