Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP3P08254 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP3P08254 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP3P08254 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP3P08254 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP3P08254 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP3P08254 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP3P08254 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP3P08254 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP3P08254 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP3P08254 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP3P08254 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP3P08254 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP3P08254 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP3P08254 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP3P08254 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP3P08254 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP3P08254 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP3P08254 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP3P08254 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP3P08254 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP3P08254 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP3P08254 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP3P08254 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP3P08254 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP3P08254 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP3P08254 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP3P08254 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP3P08254 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP3P08254 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP3P08254 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP3P08254 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP3P08254 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP3P08254 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP3P08254 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP3P08254 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP3P08254 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP3P08254 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP3P08254 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP3P08254 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP3P08254 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP3P08254 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP3P08254 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP3P08254 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP3P08254 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP3P08254 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP3P08254 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP3P08254 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP3P08254 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP3P08254 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP3P08254 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP3P08254 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP3P08254 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP3P08254 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP3P08254 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP3P08254 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP3P08254 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP3P08254 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP3P08254 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP3P08254 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP3P08254 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP3P08254 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP3P08254 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP3P08254 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP3P08254 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP3P08254 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP3P08254 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP3P08254 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms