Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCA5LO95447 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms