Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX1O43812 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX1O43812 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX1O43812 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX1O43812 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX1O43812 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX1O43812 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX1O43812 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX1O43812 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX1O43812 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUX1O43812 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX1O43812 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX1O43812 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX1O43812 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX1O43812 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX1O43812 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX1O43812 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX1O43812 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX1O43812 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX1O43812 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX1O43812 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX1O43812 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX1O43812 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX1O43812 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX1O43812 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX1O43812 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX1O43812 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX1O43812 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX1O43812 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX1O43812 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX1O43812 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX1O43812 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX1O43812 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX1O43812 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUX1O43812 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUX1O43812 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUX1O43812 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUX1O43812 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX1O43812 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX1O43812 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX1O43812 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX1O43812 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX1O43812 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX1O43812 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX1O43812 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX1O43812 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX1O43812 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUX1O43812 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUX1O43812 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUX1O43812 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUX1O43812 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUX1O43812 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUX1O43812 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms