Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NJR5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NJR5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NJR5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NJR5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NJR5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NJR5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NJR5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NJR5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NJR5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
A6NJR5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
A6NJR5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A6NJR5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A6NJR5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A6NJR5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A6NJR5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A6NJR5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A6NJR5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A6NJR5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A6NJR5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NJR5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NJR5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NJR5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NJR5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NJR5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NJR5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NJR5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NJR5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NJR5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NJR5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NJR5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NJR5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NJR5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NJR5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NJR5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NJR5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NJR5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NJR5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NJR5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NJR5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NJR5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NJR5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NJR5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NJR5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NJR5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NJR5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NJR5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NJR5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NJR5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NJR5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NJR5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NJR5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NJR5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NJR5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NJR5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NJR5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NJR5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NJR5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A6NJR5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A6NJR5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A6NJR5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
A6NJR5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
A6NJR5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A6NJR5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A6NJR5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A6NJR5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A6NJR5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A6NJR5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A6NJR5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NJR5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NJR5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NJR5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NJR5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NJR5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NJR5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NJR5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NJR5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NJR5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NJR5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NJR5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NJR5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NJR5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NJR5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NJR5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NJR5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NJR5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NJR5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms