Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms