Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABRG3Q99928 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms