Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNQ99608 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNQ99608 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNQ99608 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNQ99608 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNQ99608 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNQ99608 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNQ99608 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNQ99608 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNQ99608 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNQ99608 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNQ99608 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
NDNQ99608 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNQ99608 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDNQ99608 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDNQ99608 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDNQ99608 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDNQ99608 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDNQ99608 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNQ99608 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNQ99608 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNQ99608 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNQ99608 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNQ99608 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNQ99608 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNQ99608 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNQ99608 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNQ99608 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNQ99608 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNQ99608 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDNQ99608 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDNQ99608 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDNQ99608 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDNQ99608 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDNQ99608 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDNQ99608 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDNQ99608 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNQ99608 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNQ99608 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNQ99608 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNQ99608 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNQ99608 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNQ99608 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNQ99608 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNQ99608 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms