Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms