Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms