Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms