Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRKQ15262 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRKQ15262 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PTPRKQ15262 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PTPRKQ15262 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRKQ15262 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRKQ15262 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRKQ15262 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRKQ15262 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRKQ15262 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRKQ15262 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRKQ15262 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRKQ15262 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRKQ15262 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PTPRKQ15262 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRKQ15262 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRKQ15262 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRKQ15262 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRKQ15262 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PTPRKQ15262 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRKQ15262 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRKQ15262 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRKQ15262 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRKQ15262 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRKQ15262 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRKQ15262 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
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