Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPTAN1Q13813 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms