Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms