Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00205P59089 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms