Protein–RNA interactions for Protein: P01767

IGHV3-53, Immunoglobulin heavy variable 3-53, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-53P01767 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-53P01767 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-53P01767 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms