Protein–RNA interactions for Protein: O15164

TRIM24, Transcription intermediary factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM24O15164 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM24O15164 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM24O15164 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms