Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.8 ms