Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms