Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms