Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA4Q9GZZ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 801.4 ms