Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPL1Q96JK4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HHIPL1Q96JK4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms