Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
HHIPL1Q96JK4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.95■■■■■ 4.15
HHIPL1Q96JK4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
HHIPL1Q96JK4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
HHIPL1Q96JK4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
HHIPL1Q96JK4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
HHIPL1Q96JK4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
HHIPL1Q96JK4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
HHIPL1Q96JK4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
HHIPL1Q96JK4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
HHIPL1Q96JK4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
HHIPL1Q96JK4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
HHIPL1Q96JK4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HHIPL1Q96JK4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
HHIPL1Q96JK4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
HHIPL1Q96JK4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
HHIPL1Q96JK4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
HHIPL1Q96JK4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
HHIPL1Q96JK4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
HHIPL1Q96JK4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
HHIPL1Q96JK4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
HHIPL1Q96JK4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
HHIPL1Q96JK4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
HHIPL1Q96JK4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
HHIPL1Q96JK4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HHIPL1Q96JK4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
HHIPL1Q96JK4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
HHIPL1Q96JK4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
HHIPL1Q96JK4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
HHIPL1Q96JK4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
HHIPL1Q96JK4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
HHIPL1Q96JK4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
HHIPL1Q96JK4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
HHIPL1Q96JK4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
HHIPL1Q96JK4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
HHIPL1Q96JK4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
HHIPL1Q96JK4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
HHIPL1Q96JK4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
HHIPL1Q96JK4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
HHIPL1Q96JK4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
HHIPL1Q96JK4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HHIPL1Q96JK4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HHIPL1Q96JK4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HHIPL1Q96JK4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HHIPL1Q96JK4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HHIPL1Q96JK4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
HHIPL1Q96JK4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HHIPL1Q96JK4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HHIPL1Q96JK4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HHIPL1Q96JK4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HHIPL1Q96JK4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HHIPL1Q96JK4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HHIPL1Q96JK4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HHIPL1Q96JK4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HHIPL1Q96JK4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HHIPL1Q96JK4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HHIPL1Q96JK4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
HHIPL1Q96JK4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
HHIPL1Q96JK4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
HHIPL1Q96JK4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HHIPL1Q96JK4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HHIPL1Q96JK4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HHIPL1Q96JK4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HHIPL1Q96JK4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HHIPL1Q96JK4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HHIPL1Q96JK4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
HHIPL1Q96JK4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HHIPL1Q96JK4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HHIPL1Q96JK4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HHIPL1Q96JK4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HHIPL1Q96JK4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HHIPL1Q96JK4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
HHIPL1Q96JK4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HHIPL1Q96JK4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
HHIPL1Q96JK4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HHIPL1Q96JK4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
HHIPL1Q96JK4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HHIPL1Q96JK4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
HHIPL1Q96JK4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HHIPL1Q96JK4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HHIPL1Q96JK4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HHIPL1Q96JK4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
HHIPL1Q96JK4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
HHIPL1Q96JK4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
HHIPL1Q96JK4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
HHIPL1Q96JK4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HHIPL1Q96JK4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
HHIPL1Q96JK4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
HHIPL1Q96JK4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
HHIPL1Q96JK4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
HHIPL1Q96JK4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
HHIPL1Q96JK4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HHIPL1Q96JK4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
HHIPL1Q96JK4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
HHIPL1Q96JK4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HHIPL1Q96JK4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HHIPL1Q96JK4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HHIPL1Q96JK4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
HHIPL1Q96JK4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
HHIPL1Q96JK4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms