Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CELF1Q92879 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CELF1Q92879 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms