Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN4YQ8NFZ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms