Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CRIP3Q6Q6R5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRIP3Q6Q6R5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRIP3Q6Q6R5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRIP3Q6Q6R5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CRIP3Q6Q6R5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRIP3Q6Q6R5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms