Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARBP10826 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARBP10826 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARBP10826 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARBP10826 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARBP10826 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARBP10826 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARBP10826 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARBP10826 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARBP10826 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARBP10826 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARBP10826 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARBP10826 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARBP10826 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARBP10826 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RARBP10826 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARBP10826 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARBP10826 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARBP10826 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARBP10826 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARBP10826 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARBP10826 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARBP10826 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARBP10826 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARBP10826 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARBP10826 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARBP10826 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RARBP10826 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARBP10826 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARBP10826 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARBP10826 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RARBP10826 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RARBP10826 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARBP10826 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARBP10826 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARBP10826 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARBP10826 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARBP10826 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RARBP10826 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RARBP10826 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARBP10826 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARBP10826 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARBP10826 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARBP10826 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARBP10826 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARBP10826 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARBP10826 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARBP10826 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARBP10826 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARBP10826 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RARBP10826 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RARBP10826 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RARBP10826 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RARBP10826 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RARBP10826 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARBP10826 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARBP10826 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RARBP10826 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RARBP10826 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARBP10826 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARBP10826 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARBP10826 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARBP10826 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARBP10826 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARBP10826 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARBP10826 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARBP10826 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms