Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APODP05090 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APODP05090 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APODP05090 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APODP05090 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APODP05090 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APODP05090 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APODP05090 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APODP05090 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APODP05090 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APODP05090 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APODP05090 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APODP05090 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
APODP05090 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
APODP05090 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
APODP05090 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APODP05090 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APODP05090 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APODP05090 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APODP05090 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APODP05090 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APODP05090 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APODP05090 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APODP05090 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APODP05090 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APODP05090 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APODP05090 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APODP05090 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APODP05090 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APODP05090 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APODP05090 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APODP05090 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APODP05090 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APODP05090 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APODP05090 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APODP05090 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APODP05090 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms