Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1P04632 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1P04632 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms